抗菌药物是妊娠期最常用药物之一。尽管该类药物在产科临床使用已达数十年之久，但一直缺乏大规模人类致畸性研究。近年来，借助正在进行的全美出生缺陷预防研究(NBDPS)，得以了解某些药物与特定出生缺陷风险的有关知识。NBDPS是一项基于美国人群的大样本、高检验效能的病例对照研究，旨在探索孕早期药物暴露与大约30种特定严重出生缺陷的相关性。
然而，随着研究数据的陆续公布，对一些常用药物的安全性解释可能会给产科实践带来困惑。2009年发表的一项有关特定先天异常与孕前1个月至孕早期11类抗菌药物暴露的相关性分析便是一个例子。该研究对13,155例出生缺陷婴儿的母亲与4,941例非畸形对照婴儿的母亲进行调查，比较孕前抗菌药物暴露情况(Arch. Pediatr. Adolesc. Med. 2009;163:978-85)。

研究显示，报告妊娠期至少暴露于1种抗菌药物的母亲比例较高，两组均约占30%，尽管后者中超过30%未能回忆起所服药物的具体种类。虽然包括青霉素和红霉素等大多数类型抗菌药物的研究结果令人放心，但常用于治疗尿路感染的两类药物呋喃妥英和磺胺类药物分别与4种和6种先天异常有关。

研究者承认该项研究存在局限性：抗菌药物暴露数据是基于产后2年的回忆，其他基础疾病用药也可能对结果有影响。此外，该研究进行了300多项对比分析，难以准确判定妊娠期某种药物暴露时间与特定缺陷胚胎发育关键时期相吻合。此外，匈牙利一项既往病例对照研究也没有发现孕早期呋喃妥英暴露与出生缺陷风险增加有关的证据。鉴于上述原因，美国研究者认为其发现尚需进一步研究证实。

然而，进一步研究需要时间，但临床治疗决定却刻不容缓。为此，美国妇产科医师协会(ACOG)鉴于该研究存在局限、缺乏确凿证据以及临床治疗需要，于2011年6月发布了一项委员会意见(#494)，提出这两种药物不可用于孕早期孕妇，除非没有合适替代药物。

今后诸如NBDPS等大规模病例对照研究结果发表后，将会带来许多类似的问题。对于公共健康而言，更多有关妊娠期用药风险的高质量数据无疑是一个巨大的进步。与此同时，针对这些常常产生假设的研究结果，急需一种系统、快速评估其对临床实践影响的方法(如ACOG委员会意见)，也急需一种利用一个或多个其他数据库(大型索赔数据库或其他妊娠期用药风险与受益研究大型数据资源)对该假设进行系统、相对快速验证的方法。